Музей-заповедник охватывает Валаамский архипелаг в северной Ладоге: скалистые острова, монастырские скиты, старые аллеи и сосняки на гранитных берегах. Автомобильной дороги на Валаам нет — на остров ходят «метеоры» и теплоходы из Сортавалы и Приозерска, машину оставляют на материке. Поездка обычно занимает целый день, а расписание рейсов сильно зависит от погоды на озере.